Em alguns casos de doenças, pode-se presumir uma deficiência de Ómega-3, e a ingestão de ácidos gordos Ómega-3 pode aliviar o curso da doença. De um modo geral, a dieta ocidental está frequentemente associada a uma deficiência de Ómega-3. Os sinais diretos raramente são notados, pois muitas vezes já fazem parte do dia a dia e as pessoas aprenderam a conviver com eles (distúrbios do sono, falta de concentração, problemas digestivos, etc.). Além disso, muitas doenças autoimunes podem ser causadas por uma deficiência de ácidos gordos Ómega-3, mesmo que antes não tenham sido notadas alterações no corpo.